Webb23 sep. 2024 · 1、软件安装 conda install plink 2、简单操作 本次使用train.vcf.gz 作为例子 第一步:将vcf转换为plink格式 plink --vcf F_M_trans.recode.vcf.gz --recode --out testacc --const-fid --allow-extra-chr # --vcf vcf 或者vcf.gz # --recode 输出格式 # --out 输入前缀 # --const-fid 添加群体信息 # --allow-extra-chr 允许非标准染色体编号 得到3个以.map, .nosex, … Webb16 sep. 2024 · plink是由哈佛大学开发的一个免费、开源的全基因组关联分析软件,功能非常强大。 基础的文件格式转换、质量控制,到需要大量运算的群体分层分析、连锁不平衡计算、单体型构建等,都可以通过plink完成。 详细的说明书可以查阅官方网站: http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/ 这里只介绍一些我在GWAS中运用到plink的地方。 1.下 …
How to fix Out of Memory error in windows 10 – TechCult
Webb19 sep. 2024 · 持续打鱼基础说明基本分析生成二进制PED概要统计:缺失率概要统计:等位基因频率基本的关联分析基因型和其他关联模型分层分析基本格式基础说明使用Plink1.9版本,样例数据为hapmap1运行环境为windows一下内容是基于1.07版的教程,在1.9版本上进行相应的测试,教程地址基本分析所有命令均是进入plink ... Webb21 juli 2016 · Plink actually never used more than 2GB of memory during the whole BCF conversion operation to a temporary plink file. My understanding is that after converting … cuffe and taylor tickets
Out of Memory Error in Windows 10, 8.1, 8, 7 - Technique to Fix
Webb7 juni 2024 · Tarbiat Modares University. Dear Emile Dimas. first Q: plink --bfile data --missing-genotype N --make-bed --mind 0.05 --maf 0.05 --geno 0.1 --hwe 1e-6 --recode - … Webb25 feb. 2015 · PLINK 1.07 was run with the –noweb flag. “nomem” indicates that the program ran out of memory and there was no low-memory mode or other ... uses single- instead of double-precision arithmetic, and has a high memory requirement. PLINK 1.9’s implementation of this calculation is designed to compensate for GCTA 1.24’s ... cuff earrings stainless steel